[1]陆峥,张妍妍,洪芳,等.东亚飞蝗气味结合蛋白Ⅰ的生物信息学分析[J].南京师大学报(自然科学版),2010,33(02):63-70.
　Lu Zheng,Zhang Yanyan,Hong Fang,et al.Bioinformatic Analysis on the Locusta migratoria manilensis Odorant-Binding Proteins Ⅰ[J].Journal of Nanjing Normal University(Natural Science Edition),2010,33(02):63-70.
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东亚飞蝗气味结合蛋白Ⅰ的生物信息学分析()
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《南京师大学报（自然科学版）》[ISSN:1001-4616/CN:32-1239/N]

卷:
第33卷
期数:
2010年02期
页码:
63-70
栏目:
生命科学
出版日期:
2010-06-20

文章信息/Info

Title:
Bioinformatic Analysis on the Locusta migratoria manilensis Odorant-Binding Proteins Ⅰ
作者:
陆峥;张妍妍;洪芳;蒋国芳;
南京师范大学生命科学学院, 江苏省生物资源技术重点实验室, 江苏南京210046
Author(s):
Lu Zheng; Zhang Yanyan; Hong Fang; Jiang Guofang
Jiangsu Key Laboratory for Bioresource Technology,School of Life Science,Nanjing Normal University,Nanjing 210046,China
关键词:
东亚飞蝗;  气味结合蛋白;  生物信息学;  蛋白结构和功能
Keywords:
Locusta m igrator ia manilensis;  odo rant b ind ing prote in ( OBP);  b io informa tics;  pro tein structure and function
分类号:
S433.2
摘要:
利用生物信息学方法分析了东亚飞蝗(Locusta migratoria manilensis)OBP1的核苷酸与氨基酸序列(GenBank登录号FJ215322.1/ACI30696.1),并对其组成成分、疏水/亲水区域、信号肽、跨膜结构域、蛋白质二级结构,以及分子进化关系等进行了预测与推断.结果显示,该蛋白由148个氨基酸组成,预测相对分子质量为16122.6,理论等电点(pI)为4.99,分子式为C696H1128N184O223S15;含有蛋白激酶C磷酸化位点和酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点等;具有标准的昆虫信息素/气味结合蛋白结构域.
Abstract:
The nuc leo tide and am ino acid sequences of odorant-b inding prote in I ( GenBank accession num ber: FJ2153221 1 /AC I30696.1) from Locusta m ig ratoria m anilensis we re ana lyzed and pred icted by the too ls of bio inform atics in the fo llow ing aspects: the composition, equ ipo tentia,l hydrophob ic ity or hydrophilicity, the signa l peptide, transm embrane topo log ica l structure, prote in seconda ry structure, the com position of homo logous prote in and phy logene tic re lationsh ip. The results show ed that the Lm igOBP1 gene encoded a 148 am ino ac id po lypeptides w ith a standard insect pherom one /odorant b ind ing prote in dom a in, the estima ted re la tive mo lecu lar w eigh t of 16 122.6, the theoretica l pI o f 4.99, and the struc tura l fo rmu la o f C696H1128N184O223 S15, w hich inc luded Prote in kinase C phospho ry lation sites and Case in k-i nase II phosphory lation sites.

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备注/Memo

备注/Memo:
基金项目: 国家自然科学基金( 30670257) . 通讯联系人: 蒋国芳, 教授, 博士生导师, 研究方向: 进化遗传学和分子生态学. E-mail:cnjgf1208@ 163. com
更新日期/Last Update: 2013-04-08